エピゲノム編集

定義

エピゲノム編集は、Nature Reviews Drug Discovery誌が2025年に掲載した総説「Epigenetic editing: from concept to clinic」によれば、ゲノムそのものを編集することなくエピジェネティックな特徴を書き換えることで遺伝子発現を再プログラムする手法である。同総説はこれを、下地のDNA配列を変えずに遺伝子発現を精密に改変するヒット・アンド・ラン型の手法と位置づけている。

標的認識の部品

同総説は、プログラム可能な標的認識の基盤として二系統を挙げる。ひとつは触媒活性を失わせたCas9（ヌクレアーゼ不活性型Cas9、dCas9）に各種エフェクタードメインを連結するCRISPR/dCas9系であり、もうひとつは部位選択的な標的化を担うジンクフィンガータンパク質である。

エフェクタードメイン

連結されるエフェクタードメインの働きは次のように分かれる。

• 書き込み: DNAメチル基転移酵素などがメチル化標識を付加する
• 消去: TET酵素などがメチル化標識を取り除く
• 動員: クロマチン修飾機構を呼び込みヒストン修飾を変える

ゲノム編集との違い

同総説によれば、この手法は下地のDNA配列を変えないまま、持続的（durable）な遺伝子の活性化または抑制をもたらす。配列そのものを切断・改変するゲノム編集とは、この点で区別される領域である。