Binding affinity
結合親和性は、リガンド（低分子、ペプチド、抗体など）と標的分子が形成する複合体の安定性を示す指標である。米国NIHのAssay Guidance Manualでは、平衡状態において標的の50%が占有されるために必要なリガンド濃度として説明されている。実務では平衡解離定数KDをモル濃度で表記し、値が小さいほど親和性が高いと解釈する。
結合と解離は速度論的な過程であり、結合速度定数と解離速度定数の二つで記述される。結合速度定数の単位はモル濃度の逆数と時間の逆数の積で、標的がリガンドを認識する速さを支配する。解離速度定数の単位は時間の逆数で、複合体がどれだけ壊れにくいかを表す。平衡解離定数は解離速度定数を結合速度定数で割った値として得られる。解離速度定数の逆数は滞在時間（residence time）と呼ばれ、リガンドが標的上に留まる時間の目安として使われる。同じKDでも速度定数の組み合わせは一通りではないため、親和性の数値だけでなく速度論的なプロファイルを併せて評価する場面が多い。測定には表面プラズモン共鳴やバイオレイヤー干渉法など、結合の時間変化を追える手法が用いられる。
医薬品探索では、親和性が投与量や投与間隔、標的選択性に直結するため、候補分子を絞り込む際の中心的な指標となる。計算による分子設計では、設計した候補の親和性を実験で測定し、結果をモデルへ戻す反復が前提となる。設計手法の性能を比較する際も、実験で結合が確認された割合と到達した親和性の水準が並べて示されることが多い。